男性性功能障碍是指男性在性欲、阴茎勃起、性交、性高潮、射精等性活动的五个阶段中，其中某个阶段或几个阶段或整个阶段发生异常而影响性活动正常进行。最多见的男性性功能障碍是阴茎勃起和射精异常。男性性功能是一个复杂的生理过程，涉及各方面，诸如神经、精神因素、内分泌功能、性器官等，其中大脑皮质的性条件反射起着尤为重要的主导作用。由此可见，引起男性性功能障碍的原因亦是多方面的，总体上可分为功能性性功能障碍和器质性性功能障碍两大类，前者占性功能障碍的绝大多数，而后者颇为少见。
一，功能性性功能障碍：
功能性性功能障碍：身体并没有出现生殖系统、神经系统、内分泌系统的器质性病理改变的情况。出现性功能障碍的原因是出现了性相关系统、环节功能紊乱。如：大脑皮质功能紊乱、内分泌功能失调、失平衡等。用简单的比喻就是“电脑”并没有“硬件损坏”，“死机或运行不畅”是“操作系统”或“某些软件”出现了问题。在学科划分上，功能性性功能障碍属于心理学研究范畴，功能性性功能障碍是心理学行为主义学派的一个分支。
二，器质性性功能障碍：
性功能障碍是由于生殖系统、神经系统、内分泌系统出现了器质性的病变。即“电脑”的“硬件”出现了损害，要作“硬件”的修复甚至更换了。而要修复人类的“硬件”则比较困难，这也是器质性性功能障碍治疗比较困难的原因。器质性性功能障碍属于临床医学范畴，需要到正规医院的专科进行检查治疗。
例如：脑垂体肿瘤时，性激素异常增高或降低，严重影响性功能；严重糖尿病、高血压出现血管病变后，会导致血液供应不足，出现器质性阳痿；睾丸发育不全，或者睾丸受到炎症损害后，会出现性欲、性能力低下；肾上腺增生或肿瘤时，有可能会导致性欲异常；甲亢时，会出现性欲亢奋；甲状腺功能低下时，会出现性欲下降；等等。
要正确区别功能性和器质性障碍，最好的方法当然是去医院检查身体是否患有其它疾病，疾病是否导致性器官出现器质性病变。
也可以先进行这样的简单初步判断：
１,早泄大多数是功能性原因导致。那些原来性交时间正常，最近才开始出现早泄的情况才需要考虑去医院检查是否有器质性因素导致早泄。
２,阳痿时，如果平时勃起正常，性交时却出现无法勃起或者勃起不坚，无法完全性生活。那多数是功能性原因导致的；如果任何时候都无法勃起或者勃起疲软，那就要考虑器质性因素。
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